Dr. Öğr. Üyesi Özge Kürkçüoğlu Levitas

Yrd. Doç. Dr. Özge Kürkçüoğlu Levitas

İletişim Bilgileri
Telefon:+90 (212) 285 3523 Fax:
Eposta:olevitas@itu.edu.tr Ofis:B417
Web Sayfası:http://faculty.itu.edu.tr/olevitas/
Adres:İTÜ Kimya Metalurji Fakültesi, Kimya Mühendisliği Bölümü 34469, Maslak / İstanbul

Eğitim Bilgileri Verdiği Dersler
Doktora:Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümü İstatistik ve Olasılık Teorisi; Kimya Mühendisliği Tasarım I;Kimya Mühendisliği Tasarım II;Matematiksel Modelleme; Sayısal Yöntemler
Yüksek Lisans:Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümü
Lisans:Boğaziçi Üniversitesi Kimya Mühendisliği Bölümü
Uzmanlık Alanları
Biomoleküllerin dinamiğinin matematiksel modellenmesi; Protein/DNA/RNA/ligand kompleks yapılarının yapı-işlev ilişkilerinin incelenmesi; Elastik Ağyapı Modelleri (Anisotropic network model, Gaussian network model), moleküler dinamik, Brownian dinamiği gibi modellerin çeşitli protein yapılarına uygulanması; yeni matematiksel modelleme metotlarının geliştirilmesi
Bilimsel ve Mesleki Üyelikler
Protein Society, 2004-Halen
Biophysical Society, 2006-Halen
Görevler, Ödüller ve Burslar
The 15th European Symposium on QSAR & Molecular Modeling, En iyi poster ödülü, Eylül 2004, İstanbul, Türkiye
Tripos Inc. verdiği burs ile "Vth European Workshop in Drug Design" yaz okulu, Temmuz 2005, Siena İtalya
TÜBİTAK, BIDEB-2214 Araştırma Bursu ile Iowa State University L.H. Baker Center for Bioinformatics and Biological Statistics’te misafir araştırmacı, Eylül-Kasım 2006
Boğaziçi Universitesi, Polimer Araştırma Merkezi, European 6th Framework Program COSBIOM Project, Doktora sonrası Araştırmacı, Şubat-Ağustos 2008, İstanbul, Türkiye
Cancer Research UK, London Research Institute, Biomolecular Modelling Laboratory, Doktora sonrası Araştırmacı, Ağustos 2008-Nisan 2010, Londra, İngiltere
Başlıca Yayınları
1)Kurkcuoglu, O., Jernigan, R.L. and P. Doruker (2004), Mixed Levels of Coarse-Graining of Large Proteins using Elastic Network Model Succeeds in Extracting the Slowest Motions, Polymer, 45, 649-657.
2)Kurkcuoglu, O., Jernigan, R.L. and P. Doruker (2006), Loop Motions of Triosephosphate Isomerase Observed with Elastic Networks, Biochemistry, 45, 1173-1182.
3)Kurkcuoglu, O., Doruker, P., Sen, T.Z., Kloczkowski, A. and R.L. Jernigan (2008), The Ribosome Structure Controls and Directs the mRNA Entry, Translocation and Exit Dynamics, Physical Biology, 5, 046005. Journal Cover paper. The most visited paper in Physical Biology in 2008.
4)Kurkcuoglu, O., Turgut, O.T., Cansu, S. Jernigan, R.L. and P. Doruker (2009), Focused Dynamics of Supramolecules by Use of a Mixed-Resolution Elastic Network Model, Biophysical Journal, 97(4), 1178-1187.
5)Kurkcuoglu, O. and P.A. Bates (2010), Elucidating the Functional Dynamics of the Chromosomal Regulation Protein Cohesin by Normal Mode Analysis and Molecular Dynamics, Biophysical Journal, 99(4), 1210-1220.